国家发展和改革委员会综合运输研究所成立于1959年，是我委直属的公益二类综合性科研事业单位，是中国宏观经济领域从事综合运输现代物流、现代流通体系规划发展、政策管理与决策支持研究机构。
主要为党中央国务院和委中心工作服务。同时，为地方政府部门提供交通运输、现代物流、现代流通体系发展所需的决策支持研究及咨询服务。对接我委相关司局开展交通运输、物流、现代流通体系等相关规划研究和政策研究，重大项目论证及调研等工作；完成宏观院下达的交通运输基础理论研究、形势分析研究和重点课题、应急课题研究等；从获取第一手资料和了解地方发展出发，承担地方政府部门交通运输规划、政策、重大项目论证等研究咨询；从不断提升学术质量水平出发，开展社会交通运输、物流与现代流通体系相关学术交流；全力保证完成上级领导临时交办的其他研究调查工作。