主持交通运输部《区域协调发展的交通对策研究》（“十二五”规划子课题）、中国民航局《民航落实国家区域发展战略研究》（“十三五”规划子课题）、国家发展改革委《“十四五”长江经济带综合交通运输体系规划》等国家级规划的重大课题研究。主持广东省发展改革委《广东省产业发展与港口布局规划研究》、广东省交通运输厅《广东省交通运输行政管理体制改革研究》、深圳市政府《粤港澳大湾区背景下优化深港战略通道及交通布局研究》《粤港澳大湾区港口优化协调发展研究》、南京市发展改革委《南京枢纽经济高质量发展研究》、苏州市交通运输局《苏州机场建设战略必要性研究》等课题研究工作。 专注交通运输、物流与经济社会发展的跨学科研究，探索交通物流和供应链管理的制度逻辑及政策战略。融合成本效率、制度经济、系统科学和区域经济理论，提出了交通发展的比较优势组合效率理论以及枢纽集群、交通主轴等理论观点，相继写入“十一五”国民经济和社会发展规划、国家综合交通网中长期发展规划、国家综合立体交通网规划及“十二五”交通运输规划、“十三五”中国民航发展规划等规划文本，为中国交通发展的宏观决策提供了微观基础。

专著《交通运输发展的经济分析：比较优势和制度的观点》以及《交通运输发展理论：供给侧的分析框架》《交通运输发展的中国道路》《制度创新与交通运输发展：分析框架》《交通运输新质生产力》《交通运输网络生产力》《经济转型与交通适应》《交通运输与国家发展》《交通发展与政策设计》《生态交通是未来交通发展方向》《建设包容性交通运输体系》《中国式现代化需要建设多向度枢纽化城市体系》《交通系统、区域战略与新型城镇化》《交通运输大部门体制改革的回顾与展望》《中国铁路改革与善治的基本问题》《中国城市公共汽车业改革进程与前景》等80多篇论文。